《慶余年》的故事背景設(shè)定在星球核爆后，到處都充滿(mǎn)著核輻射，地球已經(jīng)不適合人類(lèi)生存，于是幸存者們有的去了其他星球，有的在北極軍事博物館建立了不受核輻射影響的神廟。

過(guò)了不知多少年，地球上又出現(xiàn)了原始人類(lèi)，這些人類(lèi)已經(jīng)適應(yīng)了核輻射，于是，神廟派神使去教他們耕種等，從原始文明逐漸到了封建社會(huì)。

葉輕眉是現(xiàn)代的工科女博士，她穿越到神廟的一個(gè)小女孩身上，幾年之后，她厭倦了神廟生活，不想再面對(duì)冷冰冰的機(jī)器，恰逢肖恩和苦荷來(lái)神廟尋找長(zhǎng)生的秘密。

在兩人的幫助下，葉輕眉成功逃了出來(lái)，還帶走了機(jī)器人五竹、一把重型狙擊步槍和一些武功秘籍，她將其中一本武功秘籍給了苦荷，使他成為一代宗師。

葉輕眉和五竹來(lái)到東夷城后，遇見(jiàn)了四顧劍，那時(shí)的四顧劍還沒(méi)有名字，他是城主的兒子，但因?yàn)槭茄诀咚允鼙M欺凌，不僅住狗窩，還因?yàn)橄矚g數(shù)螞蟻被認(rèn)為是白癡。

在葉輕眉的幫助下，他修煉了四顧劍，成為大宗師，殺了城主一家，只有一個(gè)小弟逃了出來(lái)，這個(gè)小弟就是影子，后來(lái)他便一直跟在陳萍萍身邊，想要找機(jī)會(huì)報(bào)仇。

葉輕眉和五竹在東夷城生活了幾年后，便再次踏上征程，他們?cè)趹c國(guó)遇到了還是誠(chéng)王世子的慶帝、慶帝奶媽的兒子范建以及陳萍萍，于是便在慶國(guó)的太平別院住了下來(lái)。

她悲憫天下、性格善良、外貌美麗，想要改變這個(gè)世界，于是殺了大皇子和二皇子，助慶帝登基，建立鑒查院，監(jiān)控整個(gè)慶國(guó)，還造出玻璃等現(xiàn)代產(chǎn)物，成為一方首富。

但她覺(jué)得自己太過(guò)孤單，于是借慶帝的種子懷了范閑，想將范閑培養(yǎng)成一個(gè)擁有現(xiàn)代思想的古代人，這樣自己也能有個(gè)說(shuō)話(huà)的伴兒，可惜范閑出生時(shí)她便被慶帝設(shè)計(jì)害死了。

當(dāng)時(shí)慶帝、范建都喜歡葉輕眉，但范建礙于身份，只能將這份喜歡深埋心底，葉輕眉將陳萍萍當(dāng)做普通人看待，給予他尊重，所以對(duì)陳萍萍來(lái)說(shuō)，葉輕眉在他心中的地位比慶帝還要重要。

雖然慶帝也喜歡葉輕眉，但他更喜歡權(quán)利，葉輕眉的存在一直威脅著他的帝位，再加上太后、長(zhǎng)公主，甚至神廟的人都想殺葉輕眉，于是慶帝便有了一個(gè)天衣無(wú)縫的計(jì)劃。

大戰(zhàn)爆發(fā)，慶帝御駕親征，陳萍萍和范建都因?yàn)閼?zhàn)爭(zhēng)離開(kāi)葉輕眉身邊，五竹也被神廟的人調(diào)走，葉輕眉身邊沒(méi)人保護(hù)，在生產(chǎn)時(shí)被殺，然后五竹趕回來(lái)救走了范閑，這才有了《慶余年》的故事。